دامنه این اختلافات به حدی است که طی هفته‌های اخیر این مجمع برای تشکیل یک نشست به حد نصاب کافی نرسیده است. 

خاتمی در تازه‌ترین واکنش‌ به عملکرد این مجمع گفته است که در صورت ادامه این روند وی فعالیت‌های خود را در بنیاد باران متمرکز می‌کند.

پیش از این هم خاتمی به عنوان رئیس شورای سیاستگذاری مجمع، اعتقاد داشت نباید در سالگرد 22 خرداد بحث های بی حاصل انتخابات سال قبل و ادعاهای غیرقابل اثبات مانند تقلب در انتخابات را مطرح و مجدداً فضا را امنیتی و متشنج کرد.

اما برخی عناصر افراطی مجمع برخلاف خاتمی معتقد به تکرار حوادث ماه های پس از انتخابات بوده و توصیه می کنند که از برخوردها نباید بترسیم و به فضای اعتراض در جامعه باید دامن بزنیم تا نظام وادار به امتیازدهی شود. آنها فعالیت های جنبش سبز در سال گذشته را مثبت ارزیابی کرده و گفته اند این جنبش مانند ماری است که خفته ولی هنوز نمرده و هر وقت اراده کنیم می توانیم آن را وارد صحنه کرده و ضربه شست نشان دهیم.

لازم به ذکر است برخی اختلافات میان خاتمی و مجمع باعث شده است وی بر فعالیت های خود در بنیاد باران متمرکز شود.